科学家发现当一个人以莲花坐姿坐着时，即使不静坐冥想，他的脑波也会立刻从β波变成α波。这种转变，表示一个人的心灵变得较平静。当我们坐下来静坐时，会发现一些不纯净的思想在我们的脑中浮现。一个粗糙的心灵（意识心灵）是骚动不止的。它透过五个感觉器官（眼，耳，鼻，舌，皮肤）和五个行动器官（声带，手，脚，肛门，生殖器）四处游动，就像十只野马一样。一位伟大的瑜伽士曾说：“心灵就像一只被蝎子刺中的醉猴。”人类无休止的心灵，盲目地从一个感官的享乐奔走至另一个感官的享乐，就像一只酒瘾发作的醉猴。也像被嫉妒、贪心和自负的蝎子刺中，受到憎恨所撞击。所以，地球上最伟大的战胜者，是那些征服自己心灵的人。一个人如何征服这种骚动不止的欲望？如何获得平静的心灵呢？只有经由静坐才有获得！静坐是一种灵性的科学。教导静坐的人需要对自我本体有较高的了悟，所以只有灵性实践修练经验的人才能教导静坐。
根据现代医学的实验：当熟练禅或瑜伽静坐的人静坐时，他们的脑波是连续的α波；当一个人从事理性思考或忧虑、紧张时，他的脑波则大部分是β波。β波有较不规则的节奏。
α波是表示一种无焦虑、无紧张的状态，当一个人坐轻微静坐时，他的脑波会从β波转成α波。一般人在睡觉时才会有θ波产生，但在较深沉的静坐时，脑波大部分是θ波，且与潜意识心灵相关联。
当静坐变得更深沉时，θ波将会变成δ波。透过静坐的训练，头脑将被有系统地再造成为较健康、较协调的状态。科学的实验证明，静坐可减少沮丧、压力、冷漠、头痛、失眠和心不在焉，且能增加注意力及记忆力。自主神经系统（控制人体内部机能的部分神经）是与人脑的下视丘相连，它是由中脑的边缘系统所控制。静坐能影响一个人的中脑，并且稳定下视丘及人的情绪。
人脑的结构与核桃相似，可分成两个部分。左半边控制右半边的身体，右半边控制左边的身体。人的左脑是属于分析、逻辑和理性的，所以是倾向于科学及数学。而右脑是属于直觉和创造性的，所以是倾向于音乐和艺术。随着科学和技术的发达，我们忽略了右脑的发展。所以，为了使智力和直觉的发展谐调一致，练习静坐就是必须的了。由于脑部不同部位的缺乏整合，导致身体功能的不稳定。当脑的不同部分功能不协调时，紧张与疾病就会产生。而借着静坐我们可以避免这些问题。静坐可以增加我们的集中力，减少沮丧、痛苦及挫折。静坐者发现内在世界才是人类精细快乐的源头。
当人在静坐时，会增加百分之三十五的血液流到脑部。而提供给脑部的血量大小，与我们的心灵能力有密切的关系。而且当血量增加时，相对的氧量就会增加，如此一来，脑部的功能也获得改善。静坐也能使我们身体得到较多的休息，因为静坐时人体内氧的水平会降低百分之二十，人会感觉到完全的松弛。
